Søndag morgen starter med #arbejdsrejser forberedelser.
-
Vi er en lille gruppe der arbejder med rug genetik. 80 mennesker. I forhold til tidligere år mangler der ca 20 fra Rusland. Konference serien startede i 1965 og vi er noget til nr 12. De sidste 30 år har vi haft dem hver 4-5år. Men det er første gang jeg er med.9/n
1. Videnskabelige oplæg er om Rug genomet og status på vores viden om det af Niels Stein. Der er ekstra meget repetition i rug genomet og det er en forholdsvis lille afgrøde så det var først i 2021 vi fik det første hele genom af rug. Hurtig var der to: en linje fra KWS og en Kinesisk sort. 10/n
-
1. Videnskabelige oplæg er om Rug genomet og status på vores viden om det af Niels Stein. Der er ekstra meget repetition i rug genomet og det er en forholdsvis lille afgrøde så det var først i 2021 vi fik det første hele genom af rug. Hurtig var der to: en linje fra KWS og en Kinesisk sort. 10/n
Der er stadig masser af ulæst genom variation i rug derude. Når vi kikker i vores linjer er der ofte store stræk som ikke er på reference genomerne. 11/n
-
Der er stadig masser af ulæst genom variation i rug derude. Når vi kikker i vores linjer er der ofte store stræk som ikke er på reference genomerne. 11/n
Niels’ gruppe har opdateret KWS genomet og det kommer snart ud - vi hepper herfra
. 12/n -
Niels’ gruppe har opdateret KWS genomet og det kommer snart ud - vi hepper herfra
. 12/nNiels starter altid med “nu har jeg jo ikke lavet så meget på xxx siden sidst”. Men det har han og hans gruppe hver gang. Hvert oplæg er en fornøjelse at lytte til. Jeg har en kollega som ikke kan vente med at reanalyserer vores skuffedata op mod den nye reference. 13/n
-
Niels starter altid med “nu har jeg jo ikke lavet så meget på xxx siden sidst”. Men det har han og hans gruppe hver gang. Hvert oplæg er en fornøjelse at lytte til. Jeg har en kollega som ikke kan vente med at reanalyserer vores skuffedata op mod den nye reference. 13/n
Et PCA plot af genotypedata i første oplæg!!! Det er min type konference
️. Godt nok på byg - vi har pt kun to hele genomer på rug det bliver lidt et kedeligt plot. Næste rug konference håber jeg på et rug plot der ligner det i byg. 14/n -
Et PCA plot af genotypedata i første oplæg!!! Det er min type konference
️. Godt nok på byg - vi har pt kun to hele genomer på rug det bliver lidt et kedeligt plot. Næste rug konference håber jeg på et rug plot der ligner det i byg. 14/nI elite byg skal vi op på 50 fuld sekvens genomer før vi fanger det meste variation. Rug har et meget større genom, mere repetitiv, mere variation. Der skal formentlig mange flere til. 15/n
-
I elite byg skal vi op på 50 fuld sekvens genomer før vi fanger det meste variation. Rug har et meget større genom, mere repetitiv, mere variation. Der skal formentlig mange flere til. 15/n
Videre til Maja Boczkowska om polske genetiske ressourcer i rug. Produktionen af rug er gået ned der er enorm meget variation vi bør bevare. I forhold til de andre kornarter mister rug hurtigere spireevne efter mange år i fryseren. 16/n
-
Videre til Maja Boczkowska om polske genetiske ressourcer i rug. Produktionen af rug er gået ned der er enorm meget variation vi bør bevare. I forhold til de andre kornarter mister rug hurtigere spireevne efter mange år i fryseren. 16/n
PCA nr 2 og 3 på skærmen. Polsk rug fra genbanken er forskellige fra tyrkisk rug. Især på hvor heterozygote de er. De polske ser forholdsvis indavlede ud. Det er et problem i rug og opstår når de skal dyrke mange forskellige sorter på lille plads for at få friske frø der stadig kan spire. De dyrker dem i små telte for at undgå at de krydser med hinanden, men det giver lav population størrelse og problemer med genetisk drift og tab af diversitet. 17/n
-
PCA nr 2 og 3 på skærmen. Polsk rug fra genbanken er forskellige fra tyrkisk rug. Især på hvor heterozygote de er. De polske ser forholdsvis indavlede ud. Det er et problem i rug og opstår når de skal dyrke mange forskellige sorter på lille plads for at få friske frø der stadig kan spire. De dyrker dem i små telte for at undgå at de krydser med hinanden, men det giver lav population størrelse og problemer med genetisk drift og tab af diversitet. 17/n
Steven Dreissig om pollen morfologi. Er der forskel på pollen i rug? Er den genetisk? Hvad betyder det for rugs vindbestøvning? 18/n
-
Steven Dreissig om pollen morfologi. Er der forskel på pollen i rug? Er den genetisk? Hvad betyder det for rugs vindbestøvning? 18/n
De bruger flow cytometri til at karakterisere 64 forskellige rug sorter. Det ser ud til at strøvdragere er blevet længere og pollen er blevet større. Planterne er også kortere og til sammen giver det en kortere bestøvningsratio. 19/n
-
Steven Dreissig om pollen morfologi. Er der forskel på pollen i rug? Er den genetisk? Hvad betyder det for rugs vindbestøvning? 18/n
@pms Steven Dressing? Er det ham fra instituttet på Thousand Island?
-
De bruger flow cytometri til at karakterisere 64 forskellige rug sorter. Det ser ud til at strøvdragere er blevet længere og pollen er blevet større. Planterne er også kortere og til sammen giver det en kortere bestøvningsratio. 19/n
Fst i det 3. oplæg
️. Fst er et mål for hvor forskellig to populationer er. Meget basalt i populations genetik. Her bliver det brugt til at vise selektions signaler. Det ser ud til at der er selekteret for større pollen under domesticeringen. Tæt bestand (mindre behov for at svæve langt) og bedre spireevne i store pollen kunne drive selektionen. 20/n -
Fst i det 3. oplæg
️. Fst er et mål for hvor forskellig to populationer er. Meget basalt i populations genetik. Her bliver det brugt til at vise selektions signaler. Det ser ud til at der er selekteret for større pollen under domesticeringen. Tæt bestand (mindre behov for at svæve langt) og bedre spireevne i store pollen kunne drive selektionen. 20/n1. Oplæg fra en rugforædler Dörthe Siekmann fra Hybro. Hun fortæller om dværg rug som kan bruges til at forhindre lejesæd uden brug af stråforkorter. Det er vigtigt fordi vi får kraftige regnskyl i fremtiden og korn der ligger ned er vådt i længere tid. Det giver dårlig kvalitet korn og bøvlet høst. 21/n
-
1. Oplæg fra en rugforædler Dörthe Siekmann fra Hybro. Hun fortæller om dværg rug som kan bruges til at forhindre lejesæd uden brug af stråforkorter. Det er vigtigt fordi vi får kraftige regnskyl i fremtiden og korn der ligger ned er vådt i længere tid. Det giver dårlig kvalitet korn og bøvlet høst. 21/n
Keynote veloverstået (mere om mit oplæg senere) - vi er videre med M.rose der præsenter et projekt som ligner det projekt vi lige er startet på i år om populationsrug, økologi og bagekvalitet. Fedt at der er flere som tænker med 22/n
-
Keynote veloverstået (mere om mit oplæg senere) - vi er videre med M.rose der præsenter et projekt som ligner det projekt vi lige er startet på i år om populationsrug, økologi og bagekvalitet. Fedt at der er flere som tænker med 22/n
Andres Gordillo fra KWS om genomisk selektion i hybrider. Specifikt lige nu om prædiktion indenfor og mellem familier og indenfor og mellem krydsnings år. 23/n
-
Andres Gordillo fra KWS om genomisk selektion i hybrider. Specifikt lige nu om prædiktion indenfor og mellem familier og indenfor og mellem krydsnings år. 23/n
@pms Gordillo? Hmm, navnet siger mig noget …
Var det ikke ham, der i sin tid spillede elbas i Gogol Bordello?
-
Andres Gordillo fra KWS om genomisk selektion i hybrider. Specifikt lige nu om prædiktion indenfor og mellem familier og indenfor og mellem krydsnings år. 23/n
Så er det Peter skov Kristensen som med simulationer i ADAM-multi undersøger om vi kan få udbytte af at bruge udbytte plots fra forældrene til at forudsige vores hybrider. Det kan vi - men i praksis får vi de data samtidig med at vi for udbytte fra hybriderne selv. 24/n
-
Så er det Peter skov Kristensen som med simulationer i ADAM-multi undersøger om vi kan få udbytte af at bruge udbytte plots fra forældrene til at forudsige vores hybrider. Det kan vi - men i praksis får vi de data samtidig med at vi for udbytte fra hybriderne selv. 24/n
Det fede ved det projekt er at vi nu har en computer model af vores forædlings populationer i rug vi kan lege med og undersøge ideer inden vi tager dem med i felten. Mange spørgsmål fra andre forædlere - det er et godt redskab 25/n
-
Det fede ved det projekt er at vi nu har en computer model af vores forædlings populationer i rug vi kan lege med og undersøge ideer inden vi tager dem med i felten. Mange spørgsmål fra andre forædlere - det er et godt redskab 25/n
Godmorgen fra Ryest i Tartu Estonia! I dag starter vi med sydomsresistens. Keynote er fra Miedaner. Fusarium (en svampesygdom) har vi ikke styr på. Den er også smadder svær at score. Ingen gode data ingen god genetisk fremgang26/n
-
Godmorgen fra Ryest i Tartu Estonia! I dag starter vi med sydomsresistens. Keynote er fra Miedaner. Fusarium (en svampesygdom) har vi ikke styr på. Den er også smadder svær at score. Ingen gode data ingen god genetisk fremgang26/n
Det irriterende ved sygdomme er at de rekombinere og muterer så vi skal hele tiden finde ny resistens. 27/n
